BLASTN 2.2.3 [May-13-2002]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= BA0AB030B12LP1|AL429176
(956 letters)
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
1807 sequences; 10,358,551 total letters
Searching....done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
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3x_Contig178 109 9e-24
>3x_Contig1213
Length = 3226
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Identities = 948/956 (99%)
Strand = Plus / Minus
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>3x_Contig1773
Length = 8694
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Identities = 923/950 (97%), Gaps = 1/950 (0%)
Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 7974 attgtcatttagacttcgctcagtatagataatctaataccgccgccatgtacattagct 8033
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>3x_Contig1805
Length = 19369
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Strand = Plus / Minus
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Query: 839 ctacagca-ccattatttgaacatcagatgtaacaagtatat 879
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>3x_Contig1790
Length = 27369
Score = 1529 bits (770), Expect = 0.0
Identities = 827/846 (97%), Gaps = 2/846 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 gatcttttgagaaaaaggcttggcacmaacgctacctgatatacacaaacagtaagcgat 60
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Query: 181 atctgtcgtaatatctttagctgtatattcacttagtattttttgatgatcggtttatat 240
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Query: 241 attatcatttagacttcgctcagtatagataatctaataccgccgccatgtacattagct 300
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Query: 361 tgcctgatgcaaactccaccgctgtcaactcacttgaattggatatggtttccaattcca 420
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Sbjct: 4530 tgcctgatgcaaactccaccgctgtcaactcacttgaattcgatatggtttccaattcca 4589
Query: 421 cttcagtttgtttcaattccactaactataccattgatgtttctgagcaccctcttccag 480
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Sbjct: 4590 cttcagtttgtttcaattccactaactatgccattgatgtttctgagctccctcttccag 4649
Query: 481 aatggttagatgactgggattctttattacttgctatgccgtgcgaagatgaaattttcg 540
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Sbjct: 4650 aatggttagatgactgggattctttattacttgctatgccgtgcggtgatgaaattttcg 4709
Query: 541 tttctgttccaaaagatctggacagcaacactacagcaaagatactggcttattctttag 600
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Sbjct: 4710 tttctgttccaaaagatctggacagcaacactacagcaaagatactggcttattctttag 4769
Query: 601 cttccggtattgcagtngataattggaatagtgaactgcagaagagagaaaacattcagg 660
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Sbjct: 4770 cttctggtattgcagtggataattggaatagtgaactgcagaagagagaaaacattcagg 4829
Query: 661 cagatcttgatgccttctgggaaacaggcactgttgagctagactcgctatcaattgtac 720
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Sbjct: 4830 cagatcttgatgccttctgggaaacaggcactgttgagctagactcgctatcaattgtac 4889
Query: 721 acaattgattgcacaagaatgttgattctttgcggttgtaggggtgtttctgaggcgtca 780
| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct: 4890 aaaattgattgcacaagaatgttgtttctttgcggttgtaggggtatttctaaggcgtca 4949
Query: 781 tttattgaac--ttgctaaataagaagctgagctgagagcaactaggatcagcatcaagg 838
|||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4950 tttagtgaaccattgctaaataagaagttgagctgagagcaactaggatcagcatcaagg 5009
Query: 839 ctacag 844
||||||
Sbjct: 5010 ctacag 5015
Score = 111 bits (56), Expect = 2e-24
Identities = 69/74 (93%)
Strand = Plus / Plus
Query: 872 aagtatatgggtagatggtttcttcatccaattttcccatctggatttgacgacatawta 931
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||
Sbjct: 5044 aagtatataagtagatggtttcttcatccaatttttccatctggatttgatgacatatta 5103
Query: 932 attattgttctaca 945
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Sbjct: 5104 attattgttctaca 5117
>3x_Contig1124
Length = 2635
Score = 546 bits (275), Expect = e-155
Identities = 282/285 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 gatcttttgagaaaaaggcttggcacmaacgctacctgatatacacaaacagtaagcgat 60
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2351 gatcttttgagaaaaaggcttggcacctacgctacctgatatacacaaacagtaagcgat 2410
Query: 61 gatgacacgtagcagtacctttaatgtggtccctggcacgaatgtgtaccggtgtcaggt 120
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2411 gatgacacgtagcagttcctttaatgtggtccctggcacgaatgtgtaccggtgtcaggt 2470
Query: 121 atcaaacactaaacactcattcgtatttaccaaagatataaaataggtgttgtttactgg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2471 atcaaacactaaacactcattcgtatttaccaaagatataaaataggtgttgtttactgg 2530
Query: 181 atctgtcgtaatatctttagctgtatattcacttagtattttttgatgatcggtttatat 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2531 atctgtcgtaatatctttagctgtatattcacttagtattttttgatgatcggtttatat 2590
Query: 241 attatcatttagacttcgctcagtatagataatctaataccgccg 285
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2591 attatcatttagacttcgctcagtatagataatctaataccgccg 2635
>3x_Contig1670
Length = 9382
Score = 224 bits (113), Expect = 2e-58
Identities = 144/154 (93%), Gaps = 4/154 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 792 tgctaaataagaagctgagctgagagcaactaggatcagcatcaaggctacagcaccatt 851
|||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 152 tgctaaataagaagctgagctgagaggaactag----agcatcaaggctacagcaccatt 97
Query: 852 atttgaacatcagatgtaacaagtatatgggtagatggtttcttcatccaattttcccat 911
|||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 96 atttgaacatcagatgtaacaagtctataagtagaaggtttcttcatccaattttcccat 37
Query: 912 ctggatttgacgacatawtaattattgttctaca 945
||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 36 ctggatttgacgacatactaattattgttctaca 3
>3x_Contig178
Length = 1315
Score = 109 bits (55), Expect = 9e-24
Identities = 80/87 (91%), Gaps = 1/87 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 794 ctaaataagaagctgagctgagagcaactaggatcagcatcaaggctacagca-ccatta 852
||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct: 300 ctaaatacgcagctgagctgagaggcactaggatcagcatcaaggctacagcacccagta 241
Query: 853 tttgaacatcagatgtaacaagtatat 879
||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 240 tttgaacatcagatgcaacaagtatat 214
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
Posted date: Nov 27, 2002 12:23 PM
Number of letters in database: 10,358,551
Number of sequences in database: 1807
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 6937
Number of Sequences: 1807
Number of extensions: 6937
Number of successful extensions: 67
Number of sequences better than 1.0e-20: 7
length of query: 956
length of database: 10,358,551
effective HSP length: 16
effective length of query: 940
effective length of database: 10,329,639
effective search space: 9709860660
effective search space used: 9709860660
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.8 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 50 (99.7 bits)